A Ferencváros az NB II Keleti csoportjában 3 pontos előnnyel vonult téli pihenőre. Az MLSZ licencadó bizottsága 2006-ban zárta ki a klubot az NB I-ből, és minden évben a feljutás volt a cél.
Az FTC helyezései az NB II. Keleti csoportjában: ősz végeredmény 2006/2007: 1. FTC 37 1. Nyíregyháza 69 2. Nyíregyháza 352. FTC 65 3. Szolnok 263. Orosháza 55 2007/2008: 1. Kecskemét 33 1. Kecskemét 75 2. Szolnok 322. Szolnok 63 3. FTC 293. FTC 62 2008/2009: 1. FTC 36? 2. Bőcs 33 3. DVSC II. 29